Сирек кітаптар мен қолжазбалар қоры негізгі қордың мамандандырылған бөлімі болып табылады және жұмыс қорлар жүйесіне жатады. Бүгінгі таңда сирек кітаптар мен қолжазбалардың жинақталу жиілігі ғылымның әртүрлі салаларында XVII-XIX ғасырдың басына жатады.
Сирек кітаптар қоры ерекше тарихи, ғылыми, көркемдік, эстетикалық және полиграфиялық еңбегімен ерекшеленетін сирек немесе ерекше құнды құжаттарды қамтитын негізгі қордың бөлігі болып табылады.
1984 жылы кітапхана сирек кітаптарды сақтауға орын бөлді. Сирек кездесетін кітаптар мен қолжазбалар секторы ұйымдастырылды, қормен жұмыс басталды: кітапхананың жалпы қорынан тиісті басылымдарды іріктеу және университет оқытушыларының жеке қорларынан және кітап қорларынан сыйға тартылған әдебиеттер. Кітаптарды сыйға тартқандардың арасында әртүрлі мекемелер мен ұйымдар – Білім министрлігі, ғылыми қоғамдар, Мәскеу, Ленинград, Қазан университеттері, пайдаланылған кітап дүкендерінен сатып алулар болды, бірақ жеке тұлғалардан көптеген кітаптар келді.
Сирек кітаптар мен қолжазбалар қорына мыналар кіреді:
- қолжазба кітаптар (XVII – XIX ғғ.);
- сирек және құнды кітаптар (XIX–XXI ғғ.);
- ежелгі славян тіліндегі кітаптар;
- сирек шетелдік басылымдар (XVII-XIX ғғ.);
- миниатюралық кітаптар (ХІХ–ХХ ғғ.);
- Қазақстандық бөлім;
- жеке кітапханалардағы басылымдар;
- қазіргі басылымдар (XXI ғасыр).
Біздің бірегей сирек коллекциямыз Қазақстандағы университет кітапханаларының ішіндегі ең ірілерінің бірі және университеттің барлық ғылыми бағыттары бойынша сұранысқа ие екенін атап өткен жөн. Олардың қатарында араб, латын және кириллица қарпімен басылған тарихи-мәдени және ғылыми құнды басылымдар мен баспа кітаптары бар.Қордан XVII-XIX ғасырлардағы қолжазбалар жинақтарын, Батыс Еуропа басылымдарын, ерте баспа басылымдарын, ескі славяндық баспа басылымдарын көруге болады.
